一、国家审计机构

　　1912年9月，北洋政府在各省设置审计分处，上海审计事务由江苏省审计分处办理。1914年各省审计分处撤销，上海地区财政、财务、会计等监督部门分别办理相关的审计监督事项；财政部所辖江海关、上海造币厂等中央在沪企事业单位，由审计院负责审查核销。1927年上海特别市政府成立，市政府秘书处第三科设审计、稽核两股。审计股主要监督全市预算、决算事项和勘估监算事项。同时特设法令审查委员会，制定各项会计、审计办法。1935年4月1日，审计部上海市审计处成立，员工86人，负责办理上海市内中央及地方各机关的事前审计、事后审计和稽察工作。1937年上海沦陷，审计业务停止。
　　1938年，审计事务由伪上海特别市财政局主管，实行财审合一，后改由伪市政府秘书处第五科审计股具体负责。1942年成立伪上海特别市政府总会计处，专门负责伪市政府及所属各机关会计、审计、统计事务，并由第三科设审查、审核、稽察3股，分别办理事前审查、事后审核及稽察事项。总会计处还在重要部门设置稽核机构，如总会计处驻保安司令部总稽核室，负责有关财务审核、监督事宜。
　　抗日战争胜利后，审计部上海市审计处恢复工作。1947年，国民政府在上海设立审计部中国纺织建设公司审计办事处，市审计处设立的招商局驻审室改为审计部国营招商局审计办事处。
　　1949年5月，上海市军管会财政处接收审计部上海市审计处，市审计处停止业务。同年10月起，各级监察机关兼管审计工作。1952年，市财政局设立财政监察科，1953年改设财政监察处。1959年市财政局和市税务局合并为市财政局，未设财政监察机构。1979年市财政局重设财政监察处，各区、县财政局也设财政监察科。
　　1982年12月，第五届全国人民代表大会第五次会议通过的《中华人民共和国宪法》规定县级以上的地方各级政府设立审计机关。1984年6月18日上海市审计局成立。是年9月，12个区、10个县全部建立审计局。1985年，全市审计机关共有人员468人，其中市审计局105人，区、县审计局分别为234人、129人。1995年，设市审计局、13个区审计局、6个县审计局和浦东新区审计局。全市审计机关共有人员1184人，其中市审计局419人，区、县审计局分别为487人、278人。

　　二、内部审计机构

　　民国时期，上海地区铁路、银行、邮电、海关、盐务等国民经济重要部门，中国银行、中央银行、上海商业储蓄银行、招商局和京沪、沪杭甬铁路管理局、江南造船厂、申新纺织公司等官办和民营大型企业，都设有稽核部门，实行内部监督。1915年6月，上海商业储蓄银行成立，设查帐部，负责检查总行及分行帐目，审核全行业务。1925年，招商局成立稽核处，负责稽查各部门财务帐册。1928年，中央银行设立稽核处，负责银行一切帐务、对外契约等审核事项。京沪、沪杭甬铁路管理局内部稽核，由两方面承担，路局会计处沿路设总查帐，专事稽核；铁道部特派驻路总稽核、副总稽核，设总稽核室。路局总稽核室工作受审计部上海市审计处监督。
　　1949年5月～1983年，上海市行政机关和企事业单位未设内部审计机构。市审计局建立后，1984年9月市冶金工业局首先建立审计室，10月上海石油化工总厂建立审计室，12月市第一百货商店建立审计科。1985年4月，市机电工业局建立审计室，局属企业彭浦机器厂设立审计委员会和总审计师。1986年初，市化工局建立审计处，到年底全局系统内部审计机构组建率达到94.5%。1986年4月，南汇县老港乡在全市率先成立乡镇内部审计机构。1988年初，市商业一局建立审计处，当年全局系统有内部审计人员115人。1995年，全市共有内部审计机构1128个、内部审计人员4893人。部门、单位内部审计机构在本部门、本单位负责人的领导下，负责对本部门、本单位和所属单位的财务收支及其经济效益进行审计，业务受上级主管部门内部审计机构和同级国家审计机关指导。

　　三、社会(民间)审计机构

　　民国时期，会计师查证业务通常称为民间审计。1921年7月，会计学家徐永祚向北洋政府农商部领取会计师执照，在上海开办首家会计师事务所徐永祚会计师事务所。1925年3月，徐永祚等发起在上海成立中国第一个会计师团体上海会计师公会，30年代初会员发展到300人。1937年上海沦陷后，会计师职业呈停滞状态。抗日战争胜利后，民间审计又有较大发展。至1949年5月，全市有会计师事务所100多家、会计师500多人。
　　解放初，会计师事务所为私营厂商建立帐册、重估财产、核算成本、结算盈亏等。1956年3月，全市有执业会计师131人，另有助理员100人。全市私营工商业实行社会主义改造后，会计师事务所陆续停业，会计师转业。1981年1月，上海会计师事务所(初名上海公正会计师事务所)成立，恢复社会(民间)审计。1986年4月3日，上海审计事务所(初名上海市审计学会审计咨询服务部)成立。1988年，上海审计事务所在铁路、地质、机械、纺织、公用事业、建材和仪表等行业设立分所，各区、县成立审计事务所。1994年，全市首家集团性社会审计组织上海市审计中心成立。1995年底，全市共有审计事务所68家、从业人员2546人，其中有“两师”(注册审计师和注册会计师)资格的1766人，中高级职称人员占80%。